Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms