Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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