Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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