Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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