Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms