Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSEN1P49768 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms