Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms