Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms