Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms