Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAV1P15498 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAV1P15498 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAV1P15498 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAV1P15498 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAV1P15498 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAV1P15498 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAV1P15498 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAV1P15498 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms