Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB1P08238 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms