Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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