Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PCH4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PCH4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PCH4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PCH4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PCH4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms