Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-2B6SEH9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms