Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms