Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ2Q9P299 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms