Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms