Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms