Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF1Q9BQI6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms