Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms