Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms