Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC174Q6PII3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms