Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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