Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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