Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms