Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms