Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms