Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX3P78415 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX3P78415 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX3P78415 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX3P78415 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms