Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA4P35212 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms