Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms