Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms