Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPBP07199 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBP07199 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPBP07199 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBP07199 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms