Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QR89 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QR89 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms