Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD1B0YJ81 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms