Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms