Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUS3Q9BZE2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms