Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms