Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms