Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG2BQ96BY7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms