Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRN4CLQ8ND94 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms