Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms