Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms