Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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