Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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