Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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EXOSC2Q13868 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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EXOSC2Q13868 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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