Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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GRIK2Q13002 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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