Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 10.9
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ILF3Q12906 TTC19-206ENST00000475723 2591 ntTSL 219.41■□□□□ 0.78e-9■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.338e-9■□□□□ 10.9
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ILF3Q12906 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 57.1□□□□□ -1.278e-7■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.338e-7■□□□□ 10.8
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ILF3Q12906 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.525e-10■□□□□ 10.8
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ILF3Q12906 ENO1-205ENST00000492343 826 ntTSL 1 (best)8.18□□□□□ -1.15e-10■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 ENO1-203ENST00000486051 536 ntTSL 36.19□□□□□ -1.425e-10■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.495e-8■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.765e-8■□□□□ 10.8
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ILF3Q12906 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 411.73□□□□□ -0.534e-9■□□□□ 10.8
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ILF3Q12906 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.147e-10■□□□□ 10.8
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ILF3Q12906 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.281e-7■□□□□ 10.8
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ILF3Q12906 BRMS1L-203ENST00000548758 1077 ntTSL 1 (best)5.91□□□□□ -1.461e-7■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 SFPQ-208ENST00000485365 693 ntTSL 24.62□□□□□ -1.671e-7■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 UBE2G2-210ENST00000496395 288 ntTSL 54.37□□□□□ -1.711e-7■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 SFPQ-210ENST00000490668 434 ntTSL 24.23□□□□□ -1.731e-7■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 BRMS1L-204ENST00000551774 1201 ntTSL 1 (best)4.05□□□□□ -1.761e-7■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 53.89□□□□□ -1.791e-7■□□□□ 10.8
ILF3Q12906 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.153e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.273e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 410.44□□□□□ -0.743e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.963e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 34.31□□□□□ -1.723e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.136e-8■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 AC069277.1-203ENST00000414603 517 ntTSL 39.55□□□□□ -0.886e-8■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 AARS-204ENST00000566969 610 ntTSL 29.55□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 CCDC84-203ENST00000526463 1295 ntTSL 1 (best)20.6■□□□□ 0.895e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 CCDC84-202ENST00000524670 885 ntTSL 517.35■□□□□ 0.375e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 CCDC84-206ENST00000532132 1119 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.295e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.165e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 CCDC84-209ENST00000580556 562 ntTSL 311.9□□□□□ -0.55e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.052e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 MBD3-211ENST00000592965 568 ntTSL 423.21■■□□□ 1.312e-10■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.162e-10■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 ZNF385A-215ENST00000552382 1516 ntTSL 320.56■□□□□ 0.881e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.572e-10■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 MBD3-204ENST00000585967 583 ntTSL 417.07■□□□□ 0.322e-10■□□□□ 10.7
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 150.8 ms