Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms