Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL23P62829 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL23P62829 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms