Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA9P57773 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GJA9P57773 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GJA9P57773 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms